El registro de las actividades autónomas pueden ser muy útiles al investigador, pues permiten medir asociaciones entre neurometricos (actividades cerebrales) y respuestas fisiológicas observadas mientras la presentación de los estímulos, reforzando o no las hipótesis testadas.
Muchas respuestas autónomas pueden ofrecer medidas fisiológicas importantes para el investigador, tales como: respuesta galvánica de la piel, dilatación pupilar, variabilidad de la frecuencia cardiaca, presión sanguínea (beat to beat), medidas cuantitativas del sudor, maniobra de Valsalva, entre otras.